Повествование наше начинается там, где оканчивается история, рассказанная в аниме. Сразу обращу внимание на то, что мангу игра наша никоим образом не затрагивает, ибо сюжеты имеют разительные отличия.
О, эта прекрасная Победа с горьким привкусом потерь. Кишин Асура повержен, безумие, успевшее распространиться по всей земле, рассеялось, открывая бесконечно голубое небо. Все вздохнули с облегчением: Трио повелителей и их верные друзья хоть и не смогли предотвратить пробуждение, но, в конце концов, одержали победу над самым страшным врагом. Доказав тем самым, что Академии есть на кого положиться и Шинигами можно спокойно отправляться на покой. А ещё лучше – обязать его закатить по этому поводу большую пирушку. Впрочем, сейчас не до массовых гуляний. Куда ни посмотри, везде хаос и разруха, Город Смерти и Шибусен нуждаются в капитальном и обязательно симметричном ремонте. Так что, как говорится, покой им будет только сниться.
Косы смерти, прибывшие на помощь силам Академии, собираются в обратный путь, чтобы вновь занять свои посты смотрителей. Однако Мария не пакует чемоданы вместе с Джастином и Азусой, она приняла решение остаться преподавателем в Шибусене. К тому же, Штейн всё ещё слаб, поэтому ему просто необходима забота Марии и её умиротворяющее дыхание души.
Всё разрешилось весьма благополучно, все счастливы, но (это пресловутое «но» есть в каждой истории) плохие тети и дяди не дремлют. Как оказалось, Арахне удалось выжить, и Арахнофобия вновь сплотилась вокруг неё. Нет ничего страшнее обиженной женщины, и теперь ведьма намерена мстить. В первую очередь она бы отомстила Асуре, но его, жаль, уже нет. Следующим пунктом в её списке стоит Академия и сам Шинигами, а затем и всё сущее. План её предельно прост и не нов: погрузить весь мир в пучину безумия Кишина. Как это сделать, когда Асура мертв? Конечно, создать нового Кишина! Для этого Арахнофобии нужно либо выкрасть Хрону из Академии и довести эксперимент Медузы до конца, либо ведьме наладить отношения с младшей сестрой и попросить её о маленьком одолжении: создать нового монстра. К слову, Медуза была изгнана из тела Рейчел, но осталась жива. На то она и гениальный ученый, чтобы, просуществовав какое-то время в форме змеи, с помощью Эруки и Фри вернуть себе прежний облик. Что она намерена делать после предательства Академии? Воссоединится ли с сестрой или соберет собственное войско?